Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms