Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PTPN13Q12923 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PTPN13Q12923 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PTPN13Q12923 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PTPN13Q12923 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PTPN13Q12923 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PTPN13Q12923 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PTPN13Q12923 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PTPN13Q12923 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PTPN13Q12923 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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