Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNDQ07001 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNDQ07001 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms