Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCDQ05655 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms