Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms