Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BNC1Q01954 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms