Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-24P63145 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-24P63145 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms