Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VBP1P61758 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VBP1P61758 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VBP1P61758 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VBP1P61758 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VBP1P61758 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VBP1P61758 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VBP1P61758 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms