Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms