Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FXYD4P59646 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms