Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP9P55211 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP9P55211 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP9P55211 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms