Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAMP50895 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAMP50895 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAMP50895 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCAMP50895 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BCAMP50895 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCAMP50895 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCAMP50895 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCAMP50895 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAMP50895 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCAMP50895 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAMP50895 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAMP50895 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BCAMP50895 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCAMP50895 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAMP50895 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAMP50895 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCAMP50895 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAMP50895 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAMP50895 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCAMP50895 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAMP50895 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAMP50895 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAMP50895 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAMP50895 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCAMP50895 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAMP50895 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BCAMP50895 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BCAMP50895 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BCAMP50895 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms