Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CRIP1P50238 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms