Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2IP36954 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2IP36954 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms