Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD12P35452 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms