Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC12P31275 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms