Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms