Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PTPRMP28827 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
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