Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXP28300 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXP28300 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXP28300 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LOXP28300 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms