Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHMLP26374 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMLP26374 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMLP26374 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMLP26374 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMLP26374 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMLP26374 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMLP26374 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMLP26374 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMLP26374 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMLP26374 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMLP26374 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMLP26374 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMLP26374 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMLP26374 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMLP26374 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMLP26374 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMLP26374 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMLP26374 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMLP26374 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMLP26374 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMLP26374 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMLP26374 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHMLP26374 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHMLP26374 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CHMLP26374 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CHMLP26374 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMLP26374 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMLP26374 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMLP26374 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMLP26374 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMLP26374 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms