Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTSSP25774 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTSSP25774 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSSP25774 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSSP25774 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSSP25774 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSSP25774 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSSP25774 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSSP25774 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSSP25774 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSSP25774 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSSP25774 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSSP25774 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSSP25774 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSSP25774 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSSP25774 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSSP25774 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSSP25774 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTSSP25774 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSSP25774 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSSP25774 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSSP25774 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSSP25774 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSSP25774 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSSP25774 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSSP25774 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSSP25774 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTSSP25774 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTSSP25774 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms