Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPRDP23468 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRDP23468 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms