Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms