Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA1P20827 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms