Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 AC068205.1-201ENST00000526615 689 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB1P14653 FGA-203ENST00000622532 1130 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms