Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms