Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLBP1P12271 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms