Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PYGBP11216 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PYGBP11216 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PYGBP11216 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PYGBP11216 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PYGBP11216 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PYGBP11216 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms