Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMC1P11047 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMC1P11047 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms