Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL3P10147 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL3P10147 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms