Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM6BO15054 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM6BO15054 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms