Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP23O00161 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms