Protein–RNA interactions for Protein: H3BMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMQ9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BMQ9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BMQ9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BMQ9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BMQ9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BMQ9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BMQ9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BMQ9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BMQ9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BMQ9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BMQ9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BMQ9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BMQ9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BMQ9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BMQ9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BMQ9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H3BMQ9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H3BMQ9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H3BMQ9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H3BMQ9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
H3BMQ9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
H3BMQ9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H3BMQ9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
H3BMQ9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms