Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms