Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF316A6NFI3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms