Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
A0A0U1RQF3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
A0A0U1RQF3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
A0A0U1RQF3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
A0A0U1RQF3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
A0A0U1RQF3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
A0A0U1RQF3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
A0A0U1RQF3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
A0A0U1RQF3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
A0A0U1RQF3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
A0A0U1RQF3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
A0A0U1RQF3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
A0A0U1RQF3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
A0A0U1RQF3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
A0A0U1RQF3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
A0A0U1RQF3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A0A0U1RQF3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms