Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms