Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms