Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF5Q9Y2D1 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms