Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PACSIN3Q9UKS6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PACSIN3Q9UKS6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms