Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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SH3BP4Q9P0V3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4Q9P0V3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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