Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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TDP1Q9NUW8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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TDP1Q9NUW8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDP1Q9NUW8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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