Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPMQ9NSP4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPMQ9NSP4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms