Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms