Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8W2

LINC00472, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00472, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00472Q9H8W2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00472Q9H8W2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms