Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 LINC00992-201ENST00000504107 617 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AC106872.6-201ENST00000514228 1346 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 OR52B5P-203ENST00000641694 1313 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 DSTNP1-201ENST00000419906 465 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 HULC-201ENST00000503668 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 LACTB2-AS1-204ENST00000519167 793 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 APTX-203ENST00000379813 1121 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AP001885.1-202ENST00000444002 1255 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AL583859.2-201ENST00000634462 1127 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AF064858.1-201ENST00000417335 1412 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 LINC01377-201ENST00000505396 649 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AC016737.1-201ENST00000605739 1068 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AC010976.1-201ENST00000631170 734 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms