Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLSTN2Q9H4D0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLSTN2Q9H4D0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms