Protein–RNA interactions for Protein: Q9H299

SH3BGRL3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3Q9H299 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms