Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM5Q9C035 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms