Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms